Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms