Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3685J3QPP2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3685J3QPP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3685J3QPP2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3685J3QPP2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3685J3QPP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3685J3QPP2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms