Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm8356J3QPD3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm8356J3QPD3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm8356J3QPD3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm8356J3QPD3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm8356J3QPD3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm8356J3QPD3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm8356J3QPD3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8356J3QPD3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Gm8356J3QPD3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm8356J3QPD3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm8356J3QPD3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm8356J3QPD3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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