Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20795J3QP49 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20795J3QP49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms