Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc180J3QNE4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ccdc180J3QNE4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms