Protein–RNA interactions for Protein: J3QN05

Gm21834, Predicted gene, 21834, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21834J3QN05 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21834J3QN05 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms