Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930544D05RikJ3QK56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms