Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933406M09RikG3XA12 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms