Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmgxb3G3X9M3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms