Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sh3tc1G3X9F6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms