Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20517G3UVU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms