Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17093F6XGJ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17093F6XGJ4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms