Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21974F6W3F3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21974F6W3F3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms