Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp946F6VWU8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp946F6VWU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms