Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Rnf165E9QAU8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf165E9QAU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf165E9QAU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rnf165E9QAU8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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