Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdnE9Q9K5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms