Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms