Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Simc1E9Q6E9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms