Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms