Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
2610021A01RikE9Q0Q3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms