Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkhd1E9PZ36 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkhd1E9PZ36 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms