Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim30dE9PWL0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30dE9PWL0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30dE9PWL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms