Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgaE9PV24 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgaE9PV24 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FgaE9PV24 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FgaE9PV24 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FgaE9PV24 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FgaE9PV24 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FgaE9PV24 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FgaE9PV24 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms