Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms