Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
3425401B19RikD3Z1D3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
3425401B19RikD3Z1D3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
3425401B19RikD3Z1D3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms