Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp27D3YV89 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp27D3YV89 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms