Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11bB4XVQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms