Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc11B2RXC1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc11B2RXC1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms