Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CK137956B1AYM9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms