Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr2B1AVP0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phactr2B1AVP0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr2B1AVP0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr2B1AVP0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr2B1AVP0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr2B1AVP0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr2B1AVP0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr2B1AVP0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr2B1AVP0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms