Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prr29B1ARI9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr29B1ARI9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms