Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Gm6880A3KG45 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm6880A3KG45 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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Gm6880A3KG45 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm6880A3KG45 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm6880A3KG45 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Gm6880A3KG45 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm6880A3KG45 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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