Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Palm3A2TJV2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms