Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r232A2RTT5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms