Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabreA2AMW3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms