Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan16A2ALW2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan16A2ALW2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan16A2ALW2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms