Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gm5938A2AEN9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gm5938A2AEN9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Gm5938A2AEN9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Gm5938A2AEN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Gm5938A2AEN9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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Gm5938A2AEN9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5938A2AEN9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5938A2AEN9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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