Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms