Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm884A2A9H6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms