Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprfA2A8L5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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