Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsg1A2A825 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsg1A2A825 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsg1A2A825 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms