Protein–RNA interactions for Protein: A2A580

1700025C18Rik, MCG1027936, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025C18RikA2A580 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700025C18RikA2A580 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700025C18RikA2A580 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms