Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm27029A2A4P4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm27029A2A4P4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms