Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4921501E09RikA0A0R4J054 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms