Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trbv2A0A0B4J1G8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv2A0A0B4J1G8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trbv2A0A0B4J1G8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trbv2A0A0B4J1G8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trbv2A0A0B4J1G8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trbv2A0A0B4J1G8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trbv2A0A0B4J1G8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trbv2A0A0B4J1G8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trbv2A0A0B4J1G8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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