Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28171A0A087WQ19 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms