Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5U3

Ighv1-62-1, Immunoglobulin heavy variable 1-62-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-62-1A0A075B5U3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms