Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccl27Q9Z1X0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccl27Q9Z1X0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccl27Q9Z1X0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccl27Q9Z1X0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccl27Q9Z1X0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl27Q9Z1X0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl27Q9Z1X0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl27Q9Z1X0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl27Q9Z1X0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl27Q9Z1X0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl27Q9Z1X0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl27Q9Z1X0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccl27Q9Z1X0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccl27Q9Z1X0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccl27Q9Z1X0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms