Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Arid3bQ9Z1N7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arid3bQ9Z1N7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arid3bQ9Z1N7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arid3bQ9Z1N7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arid3bQ9Z1N7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Arid3bQ9Z1N7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arid3bQ9Z1N7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Arid3bQ9Z1N7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arid3bQ9Z1N7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arid3bQ9Z1N7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arid3bQ9Z1N7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Arid3bQ9Z1N7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arid3bQ9Z1N7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid3bQ9Z1N7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid3bQ9Z1N7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid3bQ9Z1N7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arid3bQ9Z1N7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Arid3bQ9Z1N7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Arid3bQ9Z1N7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arid3bQ9Z1N7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Arid3bQ9Z1N7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arid3bQ9Z1N7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arid3bQ9Z1N7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arid3bQ9Z1N7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arid3bQ9Z1N7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arid3bQ9Z1N7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Arid3bQ9Z1N7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arid3bQ9Z1N7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms