Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne6Q9Z140 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne6Q9Z140 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpne6Q9Z140 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpne6Q9Z140 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne6Q9Z140 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne6Q9Z140 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne6Q9Z140 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne6Q9Z140 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne6Q9Z140 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne6Q9Z140 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne6Q9Z140 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne6Q9Z140 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne6Q9Z140 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne6Q9Z140 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne6Q9Z140 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne6Q9Z140 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne6Q9Z140 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne6Q9Z140 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpne6Q9Z140 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpne6Q9Z140 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne6Q9Z140 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms